API Documentation

• pychemia package
  • Subpackages
    • pychemia.analysis package
      • Submodules
      • pychemia.analysis.analysis module
      • pychemia.analysis.changer module
      • pychemia.analysis.cluster module
      • pychemia.analysis.matching module
      • pychemia.analysis.splitting module
      • pychemia.analysis.surface module
    • pychemia.code package
      • Subpackages
        • pychemia.code.abinit package
          • Subpackages
            • pychemia.code.abinit.task package
              • Submodules
              • pychemia.code.abinit.task.relax module
              • pychemia.code.abinit.task.static module
            • pychemia.code.abinit.tests package
              • Submodules
              • pychemia.code.abinit.tests.test_abinit module
          • Submodules
          • pychemia.code.abinit.abifiles module
          • pychemia.code.abinit.abinit module
          • pychemia.code.abinit.htmlparser module
          • pychemia.code.abinit.input module
          • pychemia.code.abinit.output module
          • pychemia.code.abinit.parser module
          • pychemia.code.abinit.utils module
        • pychemia.code.dftb package
          • Subpackages
            • pychemia.code.dftb.task package
              • Submodules
              • pychemia.code.dftb.task.kpconv module
              • pychemia.code.dftb.task.relax module
              • pychemia.code.dftb.task.static module
          • Submodules
          • pychemia.code.dftb.dftb module
        • pychemia.code.fireball package
          • Subpackages
            • pychemia.code.fireball.task package
          • Submodules
          • pychemia.code.fireball.fireball module
        • pychemia.code.lennardjones package
          • Submodules
          • pychemia.code.lennardjones.lj module
        • pychemia.code.octopus package
          • Submodules
          • pychemia.code.octopus.analysis module
          • pychemia.code.octopus.input module
          • pychemia.code.octopus.merge module
        • pychemia.code.vasp package
          • Subpackages
            • pychemia.code.vasp.task package
              • Submodules
              • pychemia.code.vasp.task.convergence module
              • pychemia.code.vasp.task.elastic module
              • pychemia.code.vasp.task.polarization module
              • pychemia.code.vasp.task.relax module
              • pychemia.code.vasp.task.static module
              • pychemia.code.vasp.task.stregth module
            • pychemia.code.vasp.tests package
              • Submodules
              • pychemia.code.vasp.tests.test_vasp module
          • Submodules
          • pychemia.code.vasp.doscar module
          • pychemia.code.vasp.incar module
          • pychemia.code.vasp.kpoints module
          • pychemia.code.vasp.outcar module
          • pychemia.code.vasp.poscar module
          • pychemia.code.vasp.queue module
          • pychemia.code.vasp.vasp module
      • Submodules
      • pychemia.code.codes module
      • pychemia.code.relaxator module
      • pychemia.code.tasks module
    • pychemia.core package
      • Subpackages
        • pychemia.core.tests package
          • Submodules
          • pychemia.core.tests.test_core module
          • pychemia.core.tests.test_doctest module
      • Submodules
      • pychemia.core.composition module
      • pychemia.core.delaunay module
      • pychemia.core.from_file module
      • pychemia.core.structure module
    • pychemia.crystal package
      • Subpackages
        • pychemia.crystal.tests package
          • Submodules
          • pychemia.crystal.tests.test_doctest module
          • pychemia.crystal.tests.test_kpoints module
          • pychemia.crystal.tests.test_symmetry module
      • Submodules
      • pychemia.crystal.kpoints module
      • pychemia.crystal.lattice module
      • pychemia.crystal.symmetry module
      • pychemia.crystal.samples module
    • pychemia.db package
      • Subpackages
        • pychemia.db.tests package
          • Submodules
          • pychemia.db.tests.test_queue module
      • Submodules
      • pychemia.db.db module
      • pychemia.db.queue module
      • pychemia.db.repo module
    • pychemia.evaluator package
      • Submodules
      • pychemia.evaluator.cluster module
      • pychemia.evaluator.cluster_fireball module
      • pychemia.evaluator.direct_evaluator module
      • pychemia.evaluator.function module
      • pychemia.evaluator.functional module
      • pychemia.evaluator.vasp_evaluator module
    • pychemia.external package
      • Subpackages
        • pychemia.external.ase package
        • pychemia.external.findsym package
        • pychemia.external.pymatgen package
        • pychemia.external.symmol package
          • Submodules
          • pychemia.external.symmol.symmol module
    • pychemia.io package
      • Submodules
      • pychemia.io.ascii module
      • pychemia.io.cif module
      • pychemia.io.xyz module
    • pychemia.md package
      • Submodules
      • pychemia.md.verlet module
    • pychemia.population package
      • Subpackages
        • pychemia.population.tests package
          • Submodules
          • pychemia.population.tests.test_popu_noncoll module
          • pychemia.population.tests.test_population module
      • Submodules
      • pychemia.population.ljcluster module
      • pychemia.population.noncollinearmagmoms module
      • pychemia.population.orbitaldftu module
      • pychemia.population.realfunction module
      • pychemia.population.relaxstructures module
    • pychemia.runner package
      • Submodules
      • pychemia.runner.pbs module
      • pychemia.runner.runner module
    • pychemia.searcher package
      • Subpackages
        • pychemia.searcher.tests package
          • Submodules
          • pychemia.searcher.tests.test_searcher module
      • Submodules
      • pychemia.searcher.annealing module
      • pychemia.searcher.ant module
      • pychemia.searcher.bee module
      • pychemia.searcher.firefly module
      • pychemia.searcher.genetic module
      • pychemia.searcher.grey module
      • pychemia.searcher.harmony module
      • pychemia.searcher.mhm module
      • pychemia.searcher.searcher module
      • pychemia.searcher.swarm module
      • pychemia.searcher.swarm2 module
    • pychemia.test package
      • Submodules
      • pychemia.test.doctest_2to3 module
      • pychemia.test.test_00 module
      • pychemia.test.test_bin module
      • pychemia.test.test_zexample1 module
      • pychemia.test.test_zexample2 module
    • pychemia.utils package
      • Subpackages
        • pychemia.utils.tests package
          • Submodules
          • pychemia.utils.tests.test_doctest_utils module
          • pychemia.utils.tests.test_periodic module
          • pychemia.utils.tests.test_serializer module
      • Submodules
      • pychemia.utils.computing module
      • pychemia.utils.constants module
      • pychemia.utils.mathematics module
      • pychemia.utils.metaheuristics module
      • pychemia.utils.periodic module
      • pychemia.utils.serializer module
    • pychemia.web package